蛋白質(zhì)組（Proteome）的概念，蕞早由澳大利亞Macquarie大學(xué)的Wilkins和Williams于1994年首先提出的，是指一個基因組（Genome），或一個細(xì)胞、組織表達(dá)的所有蛋白質(zhì)。
蛋白質(zhì)組學(xué)（Proteomics）以細(xì)胞、組織或生物體全體蛋白質(zhì)為研究對象，通過高通量的色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)檢測樣品所有蛋白質(zhì)及其變化規(guī)律，包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，利用生物信息技術(shù)從整體的角度獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生，細(xì)胞代謝等過程的變化，闡明生-理或病理條件下的變化機(jī)制。

蛋白質(zhì)全譜和混合蛋白鑒定分析指的是對完整的組織、體液或其提取物混合蛋白的組分進(jìn)行分析，目的在于鑒定出盡可能多的肽段和蛋白質(zhì)分子。針對單一蛋白的鑒定，如考染及銀染的純化蛋白（不含戊二醛，戊二醛會與蛋白質(zhì)發(fā)生不可逆交聯(lián)，嚴(yán)重影響質(zhì)譜結(jié)果），對膠點或目的條帶進(jìn)行鑒定。針對混合蛋白樣本，可以收集其蛋白溶液及泳道等，利用高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用（ HPLC-MS/MS ）技術(shù)，完成對樣本的定性分析。


蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定流程
（1）樣本中蛋白質(zhì)的提取與質(zhì)控（是否能染色；條帶清晰；目的條帶準(zhǔn)確）；
（2）蛋白樣品酶解成肽段；
（3）肽段進(jìn)入液相質(zhì)譜聯(lián)用儀，先在液相中預(yù)分離；再進(jìn)入質(zhì)譜；
（4）經(jīng)過質(zhì)譜質(zhì)量分析器檢測器得到譜圖；
（5）譜圖信息經(jīng)過數(shù)據(jù)庫比對，得到肽段和蛋白的信息；
（6）生成樣品鑒定結(jié)果。