WB 是實(shí)驗(yàn)室常見(jiàn)實(shí)驗(yàn)之一,蛋白定量后,上樣之前,還需要哪些步驟制樣呢?
1. 蛋白含量測(cè)定后,遠(yuǎn)慕建議大家把各個(gè)樣品稀釋到某一固定濃度(稀釋可使用 PBS,水或裂解液),等體積等質(zhì)量上樣,計(jì)算上樣體積時(shí)需包含 loading buffer 的體積。
例如:把所有蛋白濃度都稀釋到 2ug/ul,然后與 2Xloading buffer 1:1 混合后,濃度成為 1ug/ul,建議上樣 20-30ul 即可。
2. 與 loading buffer 混勻后,要將樣品在沸水中煮 3-5 分鐘,使蛋白充分變性。也可使用 PCR 儀 95°加熱 5 分鐘。
PS:煮沸并非必須步驟,有些蛋白僅需 70℃ 煮或無(wú)需煮沸,具體請(qǐng)參照抗體要求操作。
3. 煮沸后在冰上靜置少許時(shí)間后進(jìn)行低速離心,即可上樣。剩余樣品建議分裝后保存,樣品可以在 4℃ 冰箱短時(shí)間保存,也可以在-20 或-80℃ 保存,解凍后可重新煮沸上樣。
PS:樣品凍存時(shí)間過(guò)長(zhǎng)或反復(fù)凍融會(huì)使蛋白質(zhì)的抗原特性改變,故推薦大家使用遠(yuǎn)慕生物超快速柱式法蛋白提取試劑盒,僅需幾分鐘就可完成總蛋白制備,再也不用擔(dān)心樣品質(zhì)量不好啦!
SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳中樣品為什么要加 loading buffer?
loading buffer 的功能,第一,含有指示劑溴酚藍(lán)和二甲苯氰 FF 起到指示的作用,顯示電泳的進(jìn)程,以便我們適時(shí)終止電泳;第二,成分中的甘油可以加大樣品密度,使樣品密度大于 Tris 或者其他緩沖液,從而沉降到點(diǎn)樣孔中,防止樣品飄出點(diǎn)樣孔;第三,loading buffer 中 SDS 是比較強(qiáng)的陰離子表面活性劑,與蛋白質(zhì)表面結(jié)合,覆蓋蛋白質(zhì)本身的電荷性質(zhì),使之表面帶負(fù)電荷。SDS 還可以破壞維持蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)的重要因素--疏水鍵,使蛋白質(zhì)解構(gòu)。2-ME 和 DTT 是比較強(qiáng)的還原劑,可以打開(kāi)蛋白質(zhì)分子內(nèi)和分子間的二硫鍵, 使蛋白質(zhì)亞基分離。
上樣之前煮沸的目的是什么?
煮沸樣品的目的是為了更好地將蛋白質(zhì)的高級(jí)結(jié)構(gòu)打開(kāi)。在溫度高時(shí),一方面維持蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)的各種作用力減弱,另一方面促進(jìn) SDS 的電荷覆蓋和疏水鍵打開(kāi)作用。通過(guò)上樣 buffer 和加熱的處理,蛋白樣品呈現(xiàn)帶負(fù)電荷的長(zhǎng)鏈(還原電泳),在電泳時(shí)的分子篩效應(yīng)使得泳動(dòng)只和蛋白質(zhì)大小有關(guān)(也就是表觀分子量),與蛋白形狀無(wú)關(guān)。